端午节喝雄黄酒的说法跟屈原有关，传说在屈原投河之后，屈原家乡的人为了保护屈原的遗体不被虫子或者其他鱼类损害，人们会把粽子或者咸蛋投入江中，而一位老者告诉人们说雄黄酒可以药晕鱼龙，从此之后雄黄酒的驱虫作用就被流传了下来。端午节与雄黄酒也就被联系到了一块。
我国民间有“早端午，晚中秋”之说，古人以为晨属龙，晨时正是群龙形雨之时，故在端午节早晨设雄黄酒以饮宴祈雨，希望有个风调雨顺、五谷丰登的好年景。有的地方在端午清晨，人们还喜欢把雄黄酒或雄黄水洒在屋子外，涂在小孩耳、鼻、头额和面颊上，以避除毒虫、蚊蝇叮咬，驱散瘟疫毒气。