光是清酒的天敌：一般所知道的保存酒的方法不外温度与湿度，而清酒的保存更要注意光线的遮蔽效果，因为光线的照射是清酒的天敌，清酒不但害怕阳光的照射，甚至日光灯照射过久都会使得酒质变化，如果日光灯持续照射2~3小时，不仅肉眼即可看出酒质颜色的变化，有时还会散发所谓“日光臭”的特殊臭味。为了防止光线照射影响清酒的品质与口味，购入的清酒较好能保存在日光无法照射到的地方，现今的酒瓶大多设计成深褐色或青绿色等遮阳效果佳的颜色，其目的就是便于清酒的保存。
20℃以下是较佳保存温度：除了防止光线的照射外，清酒的保存还要注意温度与湿度的控制，一般而言，保存的温度控制在20℃以下较好，由于清酒的制作过程是采用过滤及低温，因此装瓶后仍会在瓶中继续熟成，此时周遭的物理环境，对酒质的好坏便有决定性的影响，过于剧烈的温湿度变化影响清酒的品质较大，因此较好能保持低温的恒温状态。保存好的清酒其保存期限可达一年至一年半，不过若是开过瓶未喝完的酒较好能放入冰箱冰存，因为接触过空气容易氧化改变酒质，当然倒出的酒是禁止再倒回酒瓶中的。