茅台嫡系产品中，飞天茅台与其他系列酒（如茅台王子酒、茅台迎宾酒等）的酿造工艺存在显著差异，主要体现在原料、发酵次数、取酒流程、贮存时间以及勾兑工艺等方面。
飞天茅台的酿造工艺极为讲究，它采用的是本地红缨子高粱，这种高粱颗粒完整，支链淀粉含量高，单宁含量也丰富，为酱香的形成提供了得天独厚的条件。在工艺上，飞天茅台遵循的是“12987”坤沙工艺，这意味着它需要经历一年的生产周期，期间进行两次投料、九次蒸煮、八次发酵和七次取酒。这种复杂的工艺使得飞天茅台的基酒在分型定级后，需要在陶坛中贮存至少三年，再由资深品酒师将不同轮次、年份的基酒按比例勾兑，最后再贮存一年，经检验合格后才能出厂。因此，飞天茅台的酱香突出，酒体醇厚，回味悠长，空杯留香持久。
相比之下，其他系列酒如茅台王子酒和茅台迎宾酒在酿造工艺上则有所简化。茅台王子酒虽然也采用了坤沙工艺，但发酵次数、取酒轮次可能减少，贮存时间也相对较短，通常为三年。在勾兑时，虽然可能加入少量飞天茅台基酒提香，但比例较低。因此，茅台王子酒的酱香浓郁，但层次感较弱，回味较短，价格也更亲民。
而茅台迎宾酒则采用了翻沙工艺，这是利用飞天茅台第七次取酒后的酒糟，加入新高粱和新曲药酿造而成的。它的生产周期为一年，但发酵次数减少，取酒轮次也缩短至三到五次。贮存时间通常为两年，可能通过科技手段优化口感。因此，茅台迎宾酒的酱香明显，但入口较冲，回味较短，更适合日常饮用。
总的来看，飞天茅台的酿造工艺在原料、发酵、取酒、贮存等环节均更为精细，这是其品质卓越的核心原因。而其他系列酒则通过简化工艺、缩短生产周期等方式降低成本，以适应不同市场需求。飞天茅台作为茅台高端产品，其口感酱香突出、醇厚细腻、回味悠长，适合高端宴请或收藏；而其他系列酒则更适合日常饮用或大众消费。