黄酒中含多酚物质、类黑精、谷胱甘肽等生理活性成分，它们具有自由基，防止心血管病、、抗衰老等多种生理功能。
多酚物质具有很强的自由基能力。黄酒中多酚物质的来源有两方面，即来自原料（大米、小麦）和经过微生物（米曲霉、酵母菌）转换。特别是由于黄酒发酵周期长，小麦带皮发酵，麦皮中的大量多酚物质溶入酒中，因而黄酒中的多酚物质含量较高。
类黑精是美拉德反应的产物。美拉德反应是在仪器加工和贮藏过程中经常发生的反应，生成类黑精的量取决于还原糖和氨基酸的浓度。黄酒中的还原糖和氨基酸的含量高，且贮存时间长，因而生成较多的类黑精。黄酒在贮存过程中色泽变深，也与美拉德反应生成的类黑精有关。类黑精是还原性胶体，具有较强的抗突变活性。有的研究认为，其抗突变机理是致突变自由基和通过与致突变化学物结合而减少其致突变毒性。
谷胱甘肽在人体内具有重要的生理功能。当人体摄入食物中含不洁净或等有毒物时，在肝脏中谷胱甘肽能和有毒物质结合而。谷胱甘肽过氧化酶是一种含硒酶，能体内自由基的危害。黄酒中的谷胱甘肽是发酵过程中酵母分泌和自溶产生的。酵母是提取谷胱甘肽较常用的原料，一般干酵母含1%左右的谷胱甘肽。黄酒发酵周期长，酵母自溶产生的谷胱甘肽也较多。