保健酒和药酒之间的界线并不是非常的清楚，严格上来说保健酒还是从药酒发展过来的，但是保健酒并不能取代药酒，相同的药酒也是不能取代保健酒，保健酒和药酒之间还是有很大差别的。
保健酒通俗一点来说是中医药酒演变而来的，适应范围广。药酒既可治病防病，凡临床各科常见多发病和部分疑难病症均可疗之;而保健酒是用来保健，强身健体，对身体有着很好的调理功能，又可养生保健、美容润肤;还可作病后调养和日常饮酒使用而，真可谓神通广大。难怪有人称药酒为神酒，是医学宝库中的一股香泉。
保健酒的历史源远流长，中医学认为，酒乃水谷之气，味辛、甘，性大热，气味香醇，可以进入病人的心、肝二经，具有上升和发散的特性，可以通血脉、散淤血、行药势、御寒气、消冷积、矫臭矫味之功，有温通血脉，宣散药力，温暖肠胃，祛散风寒，振奋阳气，疲劳等作用。
中医科学院张保献教授介绍，与普通酒饮和药酒相比，从风味上来说，保健酒讲究色、香、味，注重药香、酒香的协调;从原料组成来说，保健酒中的原料传统食物、食药两用之药材，且中药材、饮片有毒性者则不可用;从饮用对象来说，保健酒适于健康人群、有特殊需要之健康人群、中间状态人群(介于健康与疾病之间)饮用。
食品发酵工业研究院副院长张五九教授表示，酒类产业在消费层面上与保健养生结合有着历史机缘在保健食品当中，保健酒具有食品的性质，对身体健康有效成分的摄入和愉悦心情、舒缓压力，有着独特的优势。
保健协会王中副则指出，的保健食品源于保健酒市场在1996年保健食品的概念出台以前，人们对于保健食品的认知就是从具有滋补作用的保健酒开始的可以说，是保健酒帮助国人树立了保健食品较初概念随着保健产业的不断发展，保健酒应该具有更加广阔的市场前景。