黄酒浑浊分为生物浑浊和非生物浑浊。其中生物浑浊是指酒液感染杂菌导致黄酒浑浊、酸败变质，且生物浑浊主要原因有黄酒（煎酒）温度底速度快、酒坛不彻底、坛口包扎不严密、糊泥头质量不高等因素。
黄酒浑浊沉淀物质主要为蛋白质、糊精、多酚、金属离子、糖色等。一般认为含氮物及铁离子是形成黄酒浑浊、沉淀的两类重要成分。
黄酒非生物浑浊种类
① 热浑浊：指黄酒在加热后引起蛋白质变性等造成的浑浊沉淀现象。
② 冷浑浊：是指黄酒在20℃以下，尤其是冬季，温度越低浑浊度越严重，但移至室内品温升高时，浑浊又消失的现象，故又名为“可逆性浑浊”。
③ 氧化浑浊：随着成品酒存放时间的延长，蛋白质分子发生生化反应，蛋白质氧化聚合成大分子蛋白质；总多酚也聚合为聚多酚；大分子蛋白质易与多酚结合，使酒液产生浑浊沉淀，即为氧化浑浊。在形成氧化浑浊过程中，铁离子等金属离子起催化作用。
黄酒浑浊沉淀的主要因素
① 设备和用具 如容器及管道、机械等的材料不当，就会给酒带来较多的铁、铜等金属离子，金属离子与黄酒浑浊、沉淀有密切关系。
② 原材料 如原料中的蛋白质含量及其种类、焦糖色等添加物的质量及用量，以及糖化发酵剂的种类及用量，乃至酿造用水的质量，都与成品酒的浑浊、沉淀现象有关。
③ 生产工艺 诸如配料状况、加料方式、发酵方式、发酵条件及时间、酒的压榨、澄清、过滤、条件、贮酒条件及酒龄，乃至酒脚的去除状况等，也均与成品酒的非生物稳定性相关。
④ 成品酒的质量及存放、运输
如何有效的预防黄酒浑浊、沉淀
① 从原辅料方面：提高大米的精白率，使其含有较少的蛋白质、灰分、脂肪；严格控制酿造用水中的金属离子，尤其是铁离子；目前麦曲用量普遍偏多，因为麦曲用量越大带入酒中的蛋白质和多酚就越多；糖化酶应限量使用，糖化酶的使用也容易导致黄酒浑浊；质量差的焦糖色也会引起黄酒浑浊，应使用色价高且香味正的焦糖色，以减少用量，并有利于酒质。
② 从生产工艺方面：在发酵阶段发酵温度应适当控制的较低些，发酵期尽可能长些，总之要使糖化发酵较为彻底，尤其是对蛋白质的分解要彻底；压榨后应适当延长澄清时间；煎酒时要选择恰当的温度，因为蛋白质等凝集程度是与温度、时间成正比。假如温度较低，蛋白质等凝聚较少，黄酒在以后装瓶再次容易出现热浑浊；成品坛装酒贮存期应长些，以2年以上为好。假如是瓶装酒应尽可能在室内贮存，贮存室应隔热、防潮，室温不宜过高，更不能波动较大；对于要瓶装的酒，将勾兑合格后的酒，在高于酒液冰点0.5℃的品温下冷冻数天（冷冻温度一般为-2到-6℃），使蛋白质等遇冷凝固成分析出、割除酒脚、过滤。