培养基的水分是决定微生物生长状况的关键因素之一，不同的菌体对水分需求不同，不同水分对微生物的生理代谢产物也有所影响。
根据河内白曲在不同生产阶段的生长需求各异，在河内白曲的培养过程中，二级三角瓶根据麸皮的粗细程度，笔者把水分控制在68%—70%，而浅盘培养时则减少到65%左右。
水分过大时，会造成曲子升温猛，若温度在10小时之内升至50℃左右时，麸曲会发生褐变，产生浓郁的焦糊味，曲子活性降低，影响糖化力和发酵力；而水分过小时，麸皮后，散疏干硬，接入种曲20小时后才缓缓升温，较高达35℃左右，持续不到3个小时，曲温迅速下降至30℃左右不再升温，菌丝呈星点白色状，不产丝，至培养48小时，仍呈松散的颗粒状，曲种瘦小、干硬、无松软感，糖化力、发酵力低。
因此，在以繁殖为目标的制曲工艺中，必须把曲料含水量控制在适合该菌能够生长繁殖较旺的水平上，只有这样，才能有效控制杂菌污染，即使在半开放条件下操作，仍然能够麸曲质量。