马德拉酒有4种重要的酿酒葡萄：舍西亚尔（Sercial）、华帝露（Verdelho）、布尔（Bual，有时也作“Boal”）、马姆齐（Malmsey），这4种白葡萄品种是官方推荐的酿酒品种。
马德拉岛上85%的葡萄园种植的都是黑莫乐（Tinta Negra Mole）这一红葡萄品种，它在根瘤蚜虫病（Phylloxera）席卷欧洲大陆之后取代华帝露成为了岛上种植广的葡萄品种。使用黑莫乐酿制的马德拉酒也是浅棕色的。
一瓶仅标注为“Madeira”的马德拉酒一般都是使用黑莫乐酿制的，因为使用4种传统白葡萄品种酿制的马德拉酒一般会标明葡萄品种，它们产量更低，更为珍贵，价格也更高。